植物與微生物的互助可以幫助植物抵抗病原的威脅。最直接的原因是功能微生物占據(jù)著容易受到病原微生物侵染的生態(tài)位，當(dāng)細(xì)菌在根際周圍形成生物膜時，病原微生物和生活在土壤中的寄生蟲便不能侵入。根際有益微生物可能不僅僅是作為屏障，它們也可能分泌任意一種直接對病原微生物起抑制作用的化學(xué)物質(zhì)。微生物產(chǎn)生的其他化學(xué)物質(zhì)可以用來保護(hù)植物免受可能的寄生蟲或天敵的干擾，吸引有益生物或激活植物的免疫系統(tǒng)。噬菌體（感染細(xì)菌的病毒）能夠直接殺死病原菌。

地面以下，微生物通過占據(jù)病原體容易侵染的位置來為植物提供保護(hù)。表面和內(nèi)生微生物可以分泌多種有益的化合物來保護(hù)植物，如阻止草食性動物進(jìn)食的毒素，提醒周圍植物危險信號存在的揮發(fā)性化合物和引起氣孔關(guān)閉等預(yù)防反應(yīng)的小分子物質(zhì)等。

從地上到地下，植物與微生物之間是相互影響的。土壤中微生物的行為可以引起葉片的反應(yīng)；反之亦然。比如當(dāng)番茄被早期枯萎病菌感染后，植物本身激活的免疫系統(tǒng)產(chǎn)生的應(yīng)激信號就會被根部的真菌接收。根部有益真菌利用其菌絲將脅迫信號傳遞給臨近的植物，使其做好防御準(zhǔn)備。

微生物自身會產(chǎn)生一系列的物質(zhì)來抑制或殺死與其競爭的微生物。如果一種細(xì)菌、病毒或真菌能夠抑制其他有害微生物的生存,那么可能是這種植物與此種細(xì)菌、病毒或真菌存在共生關(guān)系或為它們提供營養(yǎng)。植物-微生物的共生關(guān)系基礎(chǔ)是：植物為特定的微生物提供碳水化合物，相應(yīng)的微生物通過抑制病原菌、天敵的進(jìn)攻或者提供其他的益處來保護(hù)植物。據(jù)估計，植物的30%以上的初級產(chǎn)物（指植物通過光合作用將 CO2轉(zhuǎn)化為有機(jī)物的量）以滲出液的方式流進(jìn)土壤，因此，微生物也必須為植物提供大量的益處。

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聲明：本文來源于李俊、姜昕在中國農(nóng)業(yè)出版專著《微生物肥料生產(chǎn)應(yīng)用技術(shù)百問百答》，如有侵權(quán)請聯(lián)系刪除，謝謝 ！