酵素菌堆肥通常用作基肥，施入土壤后，能夠控制土壤的各種病害傳播，克服作物的重茬病害，并能產(chǎn)生大量的腐殖質，改善土壤的理化性狀；能夠增強土壤的保水保肥能力，提高地溫3?5℃，對各種保護地栽培的作物十分有利。   
     酵素菌是由細菌、放線菌和酵母菌組成的有益微生物群，具有很強的發(fā)酵分解能力，提高農(nóng)作物產(chǎn)量，改善農(nóng)產(chǎn)品品質，控制病蟲害發(fā)生?？梢源呋纸飧鞣N作物秸稈、樹皮、鋸末等。酵素菌肥含有機質２５％以上，氮、磷、鉀總量6%以上，能改善土壤理化性狀，酵素菌肥作基肥和追肥均可，采用溝施或穴施，勿與植株根部直接接觸，以免燒根。也可大田撒施，通過翻耕，使肥料均勻與耕層土壤混合。使用時應避免陽光直射。一般作育苗基質，每噸營養(yǎng)土添加酵素菌肥250公斤。葉菜類每畝酵素菌肥用量為100―150公斤，果菜類、甘蔗、西瓜、茶葉等每畝200―250公斤，果樹每株用量5―８公斤。并根據(jù)不同土壤和作物補施氮、磷、鉀化肥。
    酵素菌的施用地點，溫度、時間、用量等都是使用過程中應該注意的問題。只有合理施肥才能對作物起到最好的效果。本文摘自酵素菌.中國官方網(wǎng)站島本微生物技術研究所微生物發(fā)酵!